1962年。
キングコングと戦い、熱海の海へと沈んだ大怪獣ゴジラ。
その3年後に開業した「熱海ベイリゾート後楽園」では、
政府の密命を受けた研究者によってゴジラの生態調査が行なわれていた。

その調査は30年前に打ち切られたが、研究者であるあなたは
「海水温に異常な上昇がみられる」という報告を受け、熱海へと向かう。

新たに発見された当…